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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

内蒙古杭锦旗：组建暖心服务小分队******

　　【抗疫中，我们众志成城 】

　　“您有一份‘爱心药’，请注意查收！”近日，内蒙古杭锦旗伊和乌素苏木全体党员为新冠病毒感染者上门服务，这样的暖心场景在杭锦旗76个嘎查村、13个社区随处可见。各嘎查村、社区成立暖心服务小分队，第一时间将爱心防疫物资送到困难群众手中。

　　新年伊始，杭锦旗充分发挥嘎查村(社区)党组织牵头统筹作用，以党群服务中心(站)为阵地，整合嘎查村(社区)党员干部、驻村第一书记、机关企事业单位包联干部、业主委员会成员等支援力量，组建560支暖心服务小分队，通过联系走访、送医送药、代购代办等，帮助群众解决急难愁盼问题。

　　“你好，我在外地，这几天回不去，我父亲今年81岁，独自在家，想打加强针，你们能不能上门给打一下？”育才社区暖心小分队接到居民电话求助后，第一时间组织社区医务人员上门为民中A区的老人接种加强针。“家里的老人‘阳’了，开始发烧，我们子女都在外地，实在没办法，于是给村里发了求助信息。没想到1小时以后，支书就带着‘爱心防疫包’上门了，实在太感谢了！”这是发生在锡尼镇胜利村的暖心一幕。

　　随着防疫政策的调整，连日来，感冒药、退烧药的保供压力持续增大，为缓解群众的燃眉之急，杭锦旗在每个嘎查村(社区)党群服务中心都设置了“共享药箱”，采取嘎查村(社区)采购一批、居民捐赠一批的形式筹集药品，并明确专人登记、调配。通过循环使用和补充，真正让有需要的群众得到及时有效治疗。“共享药箱”一经推出，就得到广大群众的积极响应，在全旗各嘎查村(社区)形成浓厚的互帮互助氛围。

　　(光明日报记者 高平 王潇)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）